Voici les incidents et les accidents a connu Virgin Atlantic Airways.
Le 19 juin 1984, durant la finale de test de vol CAA avant l'achat définitif, un réacteur prit feu en raison d'une ingestion d'oiseau. L'avion s'est néanmoins posé sans souci.
Le 1er juin 1996, le vol VS007 venant de Londres vers Los Angeles fit un atterrissage d'urgence à Iqaluit après qu'un passagers fut victime d'une attaque cardiaque. Un des réacteurs du 747 heurta une pompe au décollage sur le tarmac, ce qui causa des dommages sérieux sur la carlingue et au réservoir. L'avion atterri et fit des réparations durant 4 jours.
Le 5 novembre 1997, un Airbus A340-300 G-VSKY dut faire un atterrissage d'urgence à l'Aéroport d'Heathrow. L'appareil et la piste furent endommagés durant l'impact à l'atterrissage. La carlingue et les passagers furent évacués sans dommage important.
Le 8 février 2005, dans l'Airbus A340-600 en route depuisHong Kong à destination de Londres, le panneau de contrôle de l'essence eu un problème technique ce qui causa un dysfonctionnement de transfert entre les réservoirs. Le moteur extérieur gauche perdi de la puissance, et peu après, le moteur extérieur droit commença également à perdre de la puissance jusqu'à ce que l'équipage fasse le transfert manuellement. L'équipage a dévié vers Amsterdam, ou l'avion fit un atterissage sans problèmes.
Le 15 juillet 2006, G-VWKD (un Airbus A340-600), pendant le décollage de Hong Kong International Airport, a été endommagé par un tailstrike et dût larguer du carburant dans l'espace aérien de Hong Kong er revenir à l'aéroport pour des réparations. G-VMEG (un autre A340-600) fût envoyé pour assurer le transport des passagers.
Le 24 août 2006, des passagers furent "emprisonnés" à bord de VS63 (a Boeing 747-400)